京都大学 京都大学

Laboratory Course in Molecular Biology

Numbering Code U-AGR06 3F315 EJ79 Year/Term 2022 ・ Intensive, First semester
Number of Credits 3 Course Type Experiment
Target Year 3rd year students Target Student
Language Japanese Day/Period Intensive
Instructor name KAMBE TAIHO (Graduate School of Biostudies Associate Professor)
GOTOU TSUYOSHI (Graduate School of Agriculture Associate Professor)
MATSUI　SHO (Graduate School of Agriculture Assistant Professor)
YOKOKAWA TAKUMI (Graduate School of Agriculture Assistant Professor)
Outline and Purpose of the Course 　分子生物学実験および実験法を通じて、核酸やタンパク質の基本的な取り扱い方法、核酸やタンパク質配列の検索法に習熟するとともに、その原理、機構について理解する。
Course Goals 　分子生物学実験のおよび実験法を通じて、基本的な核酸やタンパク質の取り扱いやその取り扱いの原理、機構について理解する。具体的には、大腸菌を用いた遺伝子の組換え方法を取り扱う。さらにバイオインフォマティックスの最初の段階として、自身が増幅した遺伝子の機能をデータバンクから検索し、解析する能力を習得させる。
Schedule and Contents 全15回で実施する。2-5限の4コマを1回とする（4 x 15 = 60コマ）。
１. 大腸菌の培養と核酸の調製（3回）
　　大腸菌の培養
　　大腸菌染色体DNAの単離
　　DNA・RNAの定量と識別
　　制限酵素反応によるDNA切断
２. GFP遺伝子の発現ベクターへのサブクローニング（6回）
　　プラスミドDNAの制限酵素による消化とアガロース電気泳動
　　フラグメント回収、ライゲーションと大腸菌へのトランスフォーメーション
　　大腸菌の培養
　　プラスミド調製と制限酵素反応によるポジティブクローンの選択
　　タンパク質生産用大腸菌への再トランスフォーメーション
３. GFPタンパク質の性状解析（2回）
　　GFPの発現と蛍光の観察
　　SDS-PAGEによるタンパク質の電気泳動
　　ImmunoblottingによるGFPタンパク質の検出
４. 大腸菌遺伝子のPCRによる増幅とシークエンス（3回）
　　大腸菌DNAからの大腸菌遺伝子のPCRによる遺伝子増幅
　　増幅DNA精製およびシークエンス解析
５. コンピュータ実習（1回）
　　制限酵素地図の作製
　　４で決定した配列からの増幅遺伝子の同定
　　いくつかの遺伝子やタンパク質のBlastサーチによる同定
　　Blastサーチで得られた文献情報からの遺伝子やタンパク質の機能の探索
Evaluation Methods and Policy 　評価基準及び方針については、当該年度農学部学生便覧記載の「評価基準及び方針」による。 より具体的には、実験および実験法終了後に提出する実験のレポートにより評価する。特に実習書に記載されている質問に対してどの程度丁寧に答えているか、また実験中疑問に感じたことに対して、どのようなアプローチで解決したか等の実習過程のわかるレポートを主たる評価基準とする。また実験および実験法の出席は、遅刻あるいは早退2回で1回欠席とする。4回以上欠席した場合は単位を認定しない。
Course Requirements ・食品基礎分子生物学・食品分子生物学等の科目を履修しておくことが望ましい。
・原則として食品生物科学科所属の学生以外は履修できない。
Study outside of Class (preparation and review) 　実験開始前に、当日行う内容について理解しておくこと。終了後、実験の操作について問題のあった部分を中心に改善点をあげて復習すること。
Textbooks Textbooks/References 　実習書を配布する。
References, etc. 　実習書に参考書の記載がある。
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